کیمیکل کے طور پر، جراثیم کش ادویات کو اپنے ذخیرہ کرنے کی جگہ پر خصوصی توجہ کی ضرورت ہوتی ہے۔ عام طور پر، جراثیم کش مادوں کو ہوادار، خشک جگہ، براہ راست سورج کی روشنی اور بچوں کی رسائی سے دور، جیسے ٹھنڈی، خشک جگہ جیسے اسٹوریج روم، کیبنٹ، یا باکس میں ذخیرہ کیا جانا چاہیے۔ مزید برآں، انہیں کھانے اور مشروبات سے دور رکھنا چاہیے تاکہ حادثاتی طور پر ادخال یا غلط استعمال کو روکا جا سکے۔ اگر جراثیم کش مائع ہے، تو اسے رساو کو روکنے کے لیے سیل بند کنٹینر میں رکھنا چاہیے۔ ذخیرہ کرتے وقت، حادثات سے بچنے کے لیے اسے دوسرے کیمیکلز سے الگ رکھنا چاہیے۔

